Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRTO14522 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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