Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CGGBP1Q9UFW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CGGBP1Q9UFW8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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