Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB3Q9UKI3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms