Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMAPO00193 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMAPO00193 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMAPO00193 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SMAPO00193 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMAPO00193 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SMAPO00193 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms