Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPREB3Q9UKI3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms