Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMB2P55268 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMB2P55268 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms