Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARID3CA6NKF2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARID3CA6NKF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms