Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRIP3Q6Q6R5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms