Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24CP53992 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms