Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR53Q7Z5U6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms