Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LARS2Q15031 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms