Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2E1P29083 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 399.8 ms