Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4AQ9UMR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC4AQ9UMR7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC4AQ9UMR7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms