Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APPL1Q9UKG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APPL1Q9UKG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL1Q9UKG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL1Q9UKG1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms