Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHOT2Q8IXI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RHOT2Q8IXI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHOT2Q8IXI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOT2Q8IXI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOT2Q8IXI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms