Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETXQ7Z333 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SETXQ7Z333 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETXQ7Z333 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETXQ7Z333 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms