Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 56.22□□□□□ -1.418e-15■■■■■ 62.7
EFTUD2Q15029 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.093e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 CHMP6-204ENST00000572778 737 ntTSL 219.79■□□□□ 0.763e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 GNB3-205ENST00000540458 2869 ntTSL 216.74■□□□□ 0.273e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 GNB3-206ENST00000541257 761 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 GNB3-207ENST00000541978 962 ntTSL 214.14□□□□□ -0.153e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 GNB3-203ENST00000537035 796 ntTSL 512.34□□□□□ -0.433e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 CHMP6-202ENST00000571457 552 ntTSL 310.44□□□□□ -0.743e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 CHMP6-203ENST00000572525 611 ntTSL 39.28□□□□□ -0.923e-11■■■■■ 62.4
EFTUD2Q15029 UNC45A-209ENST00000497152 770 ntTSL 515.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 62.3
EFTUD2Q15029 UNC45A-213ENST00000556482 582 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 62.3
EFTUD2Q15029 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-202ENST00000469042 3276 ntTSL 211.42□□□□□ -0.581e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-205ENST00000485198 2940 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.581e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-210ENST00000510100 695 ntTSL 36.69□□□□□ -1.341e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-208ENST00000496418 3684 ntTSL 26.36□□□□□ -1.391e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-206ENST00000487024 1188 ntTSL 25.28□□□□□ -1.561e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-203ENST00000477604 740 ntTSL 34.93□□□□□ -1.621e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 ACAD11-209ENST00000507705 568 ntTSL 44.78□□□□□ -1.641e-41■■■■■ 62.2
EFTUD2Q15029 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 62.1
EFTUD2Q15029 HBP1-214ENST00000498408 2332 ntTSL 25.1□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 62.1
EFTUD2Q15029 HBP1-203ENST00000463202 2646 ntTSL 1 (best)4.9□□□□□ -1.622e-8■■■■■ 62.1
EFTUD2Q15029 HBP1-202ENST00000461963 581 ntTSL 54.39□□□□□ -1.712e-8■■■■■ 62.1
EFTUD2Q15029 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.695e-9■■■■■ 62
EFTUD2Q15029 NXF1-204ENST00000527064 572 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 61.7
EFTUD2Q15029 NXF1-202ENST00000525576 572 ntTSL 410.96□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 61.7
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-208ENST00000557234 584 ntTSL 316.79■□□□□ 0.284e-14■■■■■ 61.2
EFTUD2Q15029 HSP90AA1-206ENST00000556554 552 ntTSL 26.28□□□□□ -1.44e-14■■■■■ 61.2
EFTUD2Q15029 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.943e-13■■■■■ 61.2
EFTUD2Q15029 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.463e-13■■■■■ 61.2
EFTUD2Q15029 NCAPH2-209ENST00000522304 521 ntTSL 315.47■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-201ENST00000378081 2409 ntTSL 215.87■□□□□ 0.134e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-210ENST00000477732 552 ntTSL 515.28■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-214ENST00000485738 718 ntTSL 514.8□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-213ENST00000481249 676 ntTSL 512.39□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-206ENST00000475968 933 ntTSL 512.39□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-202ENST00000378106 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-209ENST00000476536 763 ntTSL 54.5□□□□□ -1.694e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 NDUFAF5-205ENST00000469177 326 ntTSL 33.65□□□□□ -1.834e-9■■■■■ 61.1
EFTUD2Q15029 SLC11A2-220ENST00000550061 652 ntTSL 37.97□□□□□ -1.131e-13■■■■■ 61
EFTUD2Q15029 NCAPD2-209ENST00000539885 558 ntTSL 310.7□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 61
EFTUD2Q15029 EEF2-204ENST00000598182 581 ntTSL 212.59□□□□□ -0.396e-24■■■■■ 61
EFTUD2Q15029 EEF2-205ENST00000598436 549 ntTSL 212.47□□□□□ -0.416e-24■■■■■ 61
EFTUD2Q15029 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.085e-9■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 HPS1-209ENST00000470095 801 ntTSL 514.27□□□□□ -0.135e-9■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.265e-9■■■■■ 60.9
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EFTUD2Q15029 HPS1-211ENST00000478087 971 ntTSL 512.26□□□□□ -0.455e-9■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 HPS1-208ENST00000467246 2791 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 TLE3-210ENST00000557984 478 ntTSL 225.94■■□□□ 1.741e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.331e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 ANXA11-210ENST00000481805 793 ntTSL 219.82■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 MRPL51-204ENST00000540949 343 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-11■■■■■ 60.9
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EFTUD2Q15029 STAM-203ENST00000445846 740 ntTSL 412.16□□□□□ -0.461e-11■■■■■ 60.9
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EFTUD2Q15029 YIPF2-210ENST00000591872 430 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 VARS2-208ENST00000477052 552 ntTSL 310.82□□□□□ -0.681e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.811e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 LAPTM4A-202ENST00000483117 487 ntTSL 22.5□□□□□ -2.011e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.011e-11■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 ORMDL3-205ENST00000581284 561 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-14■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 CLASRP-210ENST00000588070 445 ntTSL 213.27□□□□□ -0.292e-14■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 CLASRP-216ENST00000592876 751 ntTSL 310.76□□□□□ -0.692e-14■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 XPO5-207ENST00000455854 3629 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-14■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 XPO5-209ENST00000488195 868 ntTSL 48.58□□□□□ -1.042e-14■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 MBD6-212ENST00000552163 570 ntTSL 319.84■□□□□ 0.779e-7■■■■■ 60.9
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-48■■■■■ 60.8
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-249ENST00000524180 997 ntTSL 513.75□□□□□ -0.214e-48■■■■■ 60.8
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-212ENST00000539372 1063 ntTSL 217.91■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 60.8
EFTUD2Q15029 NFKBID-208ENST00000590828 1552 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.59e-16■■■■■ 60.7
EFTUD2Q15029 RANBP1-204ENST00000416427 645 ntTSL 523.41■■□□□ 1.344e-9■■■■■ 60.6
EFTUD2Q15029 RANBP1-206ENST00000421656 333 ntTSL 314.75□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 60.6
EFTUD2Q15029 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.241e-323■■■■■ 60.6
EFTUD2Q15029 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 60.4
EFTUD2Q15029 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 60.4
EFTUD2Q15029 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 60.4
EFTUD2Q15029 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 217.63■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 60.4
EFTUD2Q15029 FLNA-212ENST00000466319 460 ntTSL 215.71■□□□□ 0.114e-20■■■■■ 60.3
EFTUD2Q15029 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.41e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 IL4I1-208ENST00000601717 2261 ntTSL 1 (best)19.82■□□□□ 0.761e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 KDELR1-202ENST00000594643 561 ntTSL 219.09■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 IL4I1-206ENST00000596022 747 ntTSL 216.5■□□□□ 0.231e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 SARS2-207ENST00000597490 308 ntTSL 516.08■□□□□ 0.161e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-206ENST00000595463 563 ntTSL 415.59■□□□□ 0.091e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NAGLU-204ENST00000591587 1493 ntTSL 515.35■□□□□ 0.051e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NUP62-204ENST00000594673 564 ntTSL 515.3■□□□□ 0.041e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-16■■■■■ 60.2
EFTUD2Q15029 NAGLU-202ENST00000586516 510 ntTSL 214.91□□□□□ -0.021e-16■■■■■ 60.2
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