Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 KIN1YDR122W 3195 nt6.12□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 GTS1YGL181W 1191 nt6.12□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 YJL043WYJL043W 774 nt6.12□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 ELP6YMR312W 822 nt6.12□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 ALG7YBR243C 1347 nt6.12□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 TCB1YOR086C 3561 nt6.12□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 SNZ1YMR096W 894 nt6.11□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 CCT5YJR064W 1689 nt6.1□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 SRP54YPR088C 1626 nt6.1□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 CTI6YPL181W 1521 nt6.1□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 ARO3YDR035W 1113 nt6.1□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 HMS2YJR147W 1077 nt6.1□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 CAN1YEL063C 1773 nt6.09□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 HHY1YEL059W 309 nt6.09□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 PAC10YGR078C 600 nt6.09□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 MRP7YNL005C 1116 nt6.09□□□□□ -1.43
PKR1Q03880 EMP65YER140W 1671 nt6.08□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 YIR035CYIR035C 765 nt6.08□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 DPH5YLR172C 903 nt6.08□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 YPT11YNL304W 1254 nt6.08□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 DCR2YLR361C 1737 nt6.08□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 GPA1YHR005C 1419 nt6.08□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 EHT1YBR177C 1356 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 YJR149WYJR149W 1215 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 CDA1YLR307W 906 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 ADH1YOL086C 1047 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 MHF1YOL086W-A 273 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 YOR012WYOR012W 414 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 PDC6YGR087C 1692 nt6.07□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 UBP13YBL067C 2244 nt6.06□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 HAL5YJL165C 2568 nt6.05□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 TPC1YGR096W 945 nt6.05□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 TES1YJR019C 1050 nt6.05□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 DAL4YIR028W 1908 nt6.05□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 QCR6YFR033C 444 nt6.04□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 LOT6YLR011W 576 nt6.04□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 NAM8YHR086W 1572 nt6.04□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 WSC3YOL105C 1671 nt6.04□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 AFG3YER017C 2286 nt6.04□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 CLN1YMR199W 1641 nt6.03□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 REX2YLR059C 810 nt6.03□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 CBK1YNL161W 2271 nt6.02□□□□□ -1.44
PKR1Q03880 MSS51YLR203C 1311 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 HNM1YGL077C 1692 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 HRA1HRA1 564 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 SMK1YPR054W 1167 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 Q0010Q0010 387 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 RGT2YDL138W 2292 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 VBA5YKR105C 1749 nt6.02□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 RBG2YGR173W 1107 nt6.01□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 RRN10YBL025W 438 nt6.01□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 MLS1YNL117W 1665 nt6.01□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 SKI2YLR398C 3864 nt6□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 POT1YIL160C 1254 nt6□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 RCF1YML030W 480 nt6□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 TAF13YML098W 504 nt6□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 LEO1YOR123C 1395 nt6□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 GPH1YPR160W 2709 nt6□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 HGH1YGR187C 1185 nt5.99□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 FCY2YER056C 1602 nt5.99□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 MTC6YHR151C 1581 nt5.98□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 TPI1YDR050C 747 nt5.98□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 VPS65YLR322W 315 nt5.98□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 RSM7YJR113C 744 nt5.97□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 SNF7YLR025W 723 nt5.97□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 YLR112WYLR112W 420 nt5.97□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 GLN3YER040W 2193 nt5.97□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 YLL058WYLL058W 1728 nt5.96□□□□□ -1.45
PKR1Q03880 SNF4YGL115W 969 nt5.96□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 YCR041WYCR041W 333 nt5.95□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 FSH2YMR222C 672 nt5.95□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 YGL260WYGL260W 231 nt5.94□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 YGR137WYGR137W 375 nt5.94□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 NOG2YNR053C 1461 nt5.94□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 TKL2YBR117C 2046 nt5.94□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 YJL195CYJL195C 702 nt5.92□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 AIM2YAL049C 741 nt5.92□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 VMA2YBR127C 1554 nt5.92□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 YBR284WYBR284W 2394 nt5.91□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 FPR2YDR519W 408 nt5.91□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 KRE1YNL322C 942 nt5.91□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 GSH1YJL101C 2037 nt5.91□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 AVT4YNL101W 2142 nt5.9□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 AIM3YBR108W 2844 nt5.9□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 NUP57YGR119C 1626 nt5.9□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 ERP2YAL007C 648 nt5.9□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 SPE2YOL052C 1191 nt5.9□□□□□ -1.46
PKR1Q03880 FET4YMR319C 1659 nt5.89□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 SNP1YIL061C 903 nt5.89□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 NTG1YAL015C 1200 nt5.89□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 THP3YPR045C 1413 nt5.89□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YKR012CYKR012C 378 nt5.88□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YLR460CYLR460C 1131 nt5.88□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 RNA170RNA170 169 nt5.88□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 RTC2YBR147W 891 nt5.88□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 RBS1YDL189W 1374 nt5.88□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 CYB2YML054C 1776 nt5.88□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 BDF2YDL070W 1917 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YLL066CYLL066C 3618 nt5.87□□□□□ -1.47
PKR1Q03880 YEL008WYEL008W 381 nt5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms