Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB10P61026 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB10P61026 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB10P61026 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB10P61026 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB10P61026 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB10P61026 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB10P61026 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB10P61026 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB10P61026 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB10P61026 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB10P61026 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB10P61026 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB10P61026 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB10P61026 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB10P61026 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB10P61026 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB10P61026 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB10P61026 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB10P61026 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB10P61026 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB10P61026 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB10P61026 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB10P61026 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB10P61026 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB10P61026 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB10P61026 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB10P61026 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB10P61026 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB10P61026 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB10P61026 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB10P61026 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB10P61026 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB10P61026 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB10P61026 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB10P61026 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB10P61026 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB10P61026 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB10P61026 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB10P61026 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB10P61026 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB10P61026 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB10P61026 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB10P61026 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB10P61026 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB10P61026 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB10P61026 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB10P61026 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB10P61026 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB10P61026 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB10P61026 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB10P61026 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB10P61026 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB10P61026 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB10P61026 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB10P61026 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB10P61026 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB10P61026 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB10P61026 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB10P61026 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB10P61026 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB10P61026 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB10P61026 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB10P61026 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB10P61026 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB10P61026 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB10P61026 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB10P61026 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB10P61026 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB10P61026 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB10P61026 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB10P61026 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB10P61026 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB10P61026 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB10P61026 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB10P61026 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB10P61026 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB10P61026 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB10P61026 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB10P61026 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB10P61026 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB10P61026 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB10P61026 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB10P61026 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB10P61026 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB10P61026 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms