Protein–RNA interactions for Protein: P50875

SPT20, Transcription factor SPT20, yeastyeast

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT20P50875 ICE2YIL090W 1476 nt7.49□□□□□ -1.21
SPT20P50875 FRA1YLL029W 2250 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT20P50875 YNL165WYNL165W 1221 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT20P50875 YBL081WYBL081W 1107 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT20P50875 AIM41YOR215C 558 nt7.48□□□□□ -1.21
SPT20P50875 PUS7YOR243C 2031 nt7.47□□□□□ -1.21
SPT20P50875 YJL160CYJL160C 864 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT20P50875 BUD20YLR074C 501 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT20P50875 LSP1YPL004C 1026 nt7.46□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT20P50875 CHS7YHR142W 951 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT20P50875 DIA4YHR011W 1341 nt7.45□□□□□ -1.22
SPT20P50875 COX16YJL003W 357 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT20P50875 LEA1YPL213W 717 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT20P50875 MRPL36YBR122C 534 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT20P50875 BNA3YJL060W 1335 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT20P50875 EEB1YPL095C 1371 nt7.44□□□□□ -1.22
SPT20P50875 MPC1YGL080W 393 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT20P50875 RRT14YIL127C 621 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YJL009WYJL009W 327 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT20P50875 MDH2YOL126C 1134 nt7.43□□□□□ -1.22
SPT20P50875 SLM3YDL033C 1254 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YIR035CYIR035C 765 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT20P50875 YJL211CYJL211C 444 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT20P50875 PMA2YPL036W 2844 nt7.42□□□□□ -1.22
SPT20P50875 ITR1YDR497C 1755 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT20P50875 FRT1YOR324C 1809 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT20P50875 CAK1YFL029C 1107 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT20P50875 OLA1YBR025C 1185 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT20P50875 OCH1YGL038C 1443 nt7.41□□□□□ -1.22
SPT20P50875 GRH1YDR517W 1119 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT20P50875 GET2YER083C 858 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT20P50875 MET22YOL064C 1074 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT20P50875 HIS3YOR202W 663 nt7.4□□□□□ -1.22
SPT20P50875 TOP3YLR234W 1971 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YBR056WYBR056W 1506 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT20P50875 CHA1YCL064C 1083 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT20P50875 PET18YCR020C 648 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT20P50875 BUB2YMR055C 921 nt7.39□□□□□ -1.23
SPT20P50875 PRC1YMR297W 1599 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT20P50875 GGC1YDL198C 903 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT20P50875 HRA1HRA1 564 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YOR343CYOR343C 327 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT20P50875 ABP1YCR088W 1779 nt7.38□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YJR149WYJR149W 1215 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT20P50875 MFT1YML062C 1179 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT20P50875 PDC6YGR087C 1692 nt7.37□□□□□ -1.23
SPT20P50875 PMT7YDR307W 1989 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT20P50875 PCL10YGL134W 1302 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT20P50875 MRP1YDR347W 966 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YER156CYER156C 1017 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YML079WYML079W 606 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YNL234WYNL234W 1281 nt7.35□□□□□ -1.23
SPT20P50875 YPR084WYPR084W 1371 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT20P50875 NSG2YNL156C 900 nt7.34□□□□□ -1.23
SPT20P50875 UTR5YEL035C 501 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT20P50875 ATP10YLR393W 840 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RNA170RNA170 169 nt7.33□□□□□ -1.24
SPT20P50875 MEP1YGR121C 1479 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT20P50875 MRS3YJL133W 945 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RMA1YKL132C 1293 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT20P50875 GDH1YOR375C 1365 nt7.32□□□□□ -1.24
SPT20P50875 NEM1YHR004C 1341 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RPL12BYDR418W 498 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 YPT31YER031C 672 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 YLR036CYLR036C 612 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 TAF4YMR005W 1167 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 PZF1YPR186C 1290 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 SIR2YDL042C 1689 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 BEM1YBR200W 1656 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 CTF3YLR381W 2202 nt7.31□□□□□ -1.24
SPT20P50875 ADA2YDR448W 1305 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 TIF3YPR163C 1311 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 BUD31YCR063W 474 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 YMR206WYMR206W 942 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 OCA1YNL099C 717 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 YNL140CYNL140C 570 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 NDE2YDL085W 1638 nt7.3□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RTG2YGL252C 1767 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT20P50875 SUA5YGL169W 1281 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT20P50875 SPE4YLR146C 903 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT20P50875 BXI1YNL305C 894 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT20P50875 NDJ1YOL104C 1059 nt7.29□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RPS6AYPL090C 711 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RHO1YPR165W 630 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT20P50875 RPS6BYBR181C 711 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT20P50875 NDE1YMR145C 1683 nt7.28□□□□□ -1.24
SPT20P50875 STD1YOR047C 1335 nt7.27□□□□□ -1.24
SPT20P50875 INO1YJL153C 1602 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT20P50875 GLY1YEL046C 1164 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT20P50875 TAD2YJL035C 753 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT20P50875 KTR3YBR205W 1215 nt7.27□□□□□ -1.25
SPT20P50875 MMS21YEL019C 804 nt7.26□□□□□ -1.25
SPT20P50875 INM1YHR046C 888 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.4 ms