Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDI2P50395 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDI2P50395 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDI2P50395 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDI2P50395 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDI2P50395 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDI2P50395 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDI2P50395 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDI2P50395 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDI2P50395 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDI2P50395 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDI2P50395 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDI2P50395 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDI2P50395 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDI2P50395 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDI2P50395 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDI2P50395 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDI2P50395 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDI2P50395 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDI2P50395 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDI2P50395 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDI2P50395 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDI2P50395 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDI2P50395 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDI2P50395 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDI2P50395 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDI2P50395 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDI2P50395 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDI2P50395 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDI2P50395 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDI2P50395 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDI2P50395 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDI2P50395 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDI2P50395 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDI2P50395 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDI2P50395 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDI2P50395 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GDI2P50395 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDI2P50395 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDI2P50395 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDI2P50395 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDI2P50395 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDI2P50395 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDI2P50395 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDI2P50395 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDI2P50395 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDI2P50395 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDI2P50395 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDI2P50395 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDI2P50395 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDI2P50395 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDI2P50395 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDI2P50395 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDI2P50395 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDI2P50395 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDI2P50395 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDI2P50395 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDI2P50395 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDI2P50395 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDI2P50395 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDI2P50395 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDI2P50395 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDI2P50395 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDI2P50395 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDI2P50395 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDI2P50395 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDI2P50395 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDI2P50395 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDI2P50395 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDI2P50395 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDI2P50395 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDI2P50395 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDI2P50395 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDI2P50395 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDI2P50395 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDI2P50395 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDI2P50395 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDI2P50395 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDI2P50395 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDI2P50395 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms