Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 ALG7YBR243C 1347 nt7.76□□□□□ -1.17
SEC28P40509 MFT1YML062C 1179 nt7.75□□□□□ -1.17
SEC28P40509 BXI1YNL305C 894 nt7.75□□□□□ -1.17
SEC28P40509 PMU1YKL128C 888 nt7.74□□□□□ -1.17
SEC28P40509 MDH2YOL126C 1134 nt7.74□□□□□ -1.17
SEC28P40509 MNN9YPL050C 1188 nt7.74□□□□□ -1.17
SEC28P40509 WSC4YHL028W 1818 nt7.73□□□□□ -1.17
SEC28P40509 TIM50YPL063W 1431 nt7.73□□□□□ -1.17
SEC28P40509 NDE1YMR145C 1683 nt7.73□□□□□ -1.17
SEC28P40509 MTC6YHR151C 1581 nt7.71□□□□□ -1.18
SEC28P40509 JHD1YER051W 1479 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC28P40509 CCR4YAL021C 2514 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC28P40509 YER156CYER156C 1017 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC28P40509 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC28P40509 ARG7YMR062C 1326 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC28P40509 PFS2YNL317W 1398 nt7.7□□□□□ -1.18
SEC28P40509 YIA6YIL006W 1122 nt7.68□□□□□ -1.18
SEC28P40509 HSV2YGR223C 1347 nt7.68□□□□□ -1.18
SEC28P40509 FIT1YDR534C 1587 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC28P40509 TES1YJR019C 1050 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC28P40509 MET30YIL046W 1923 nt7.67□□□□□ -1.18
SEC28P40509 CDA1YLR307W 906 nt7.65□□□□□ -1.18
SEC28P40509 ELP6YMR312W 822 nt7.65□□□□□ -1.18
SEC28P40509 ATP2YJR121W 1536 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC28P40509 UTR5YEL035C 501 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC28P40509 HAM1YJR069C 594 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC28P40509 YNL190WYNL190W 615 nt7.64□□□□□ -1.19
SEC28P40509 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 CKB1YGL019W 837 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 SOD2YHR008C 702 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 YIL168WYIL168W 384 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 AOS1YPR180W 1044 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 AVL9YLR114C 2295 nt7.63□□□□□ -1.19
SEC28P40509 SLM3YDL033C 1254 nt7.62□□□□□ -1.19
SEC28P40509 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.62□□□□□ -1.19
SEC28P40509 UBP13YBL067C 2244 nt7.62□□□□□ -1.19
SEC28P40509 TDH1YJL052W 999 nt7.61□□□□□ -1.19
SEC28P40509 RSC9YML127W 1746 nt7.61□□□□□ -1.19
SEC28P40509 PMA2YPL036W 2844 nt7.6□□□□□ -1.19
SEC28P40509 FRT1YOR324C 1809 nt7.6□□□□□ -1.19
SEC28P40509 RIB1YBL033C 1038 nt7.6□□□□□ -1.19
SEC28P40509 BEM1YBR200W 1656 nt7.6□□□□□ -1.19
SEC28P40509 MET13YGL125W 1803 nt7.59□□□□□ -1.19
SEC28P40509 PMT7YDR307W 1989 nt7.59□□□□□ -1.19
SEC28P40509 DST1YGL043W 930 nt7.59□□□□□ -1.19
SEC28P40509 ADA2YDR448W 1305 nt7.58□□□□□ -1.2
SEC28P40509 LAS17YOR181W 1902 nt7.58□□□□□ -1.2
SEC28P40509 YHR033WYHR033W 1272 nt7.57□□□□□ -1.2
SEC28P40509 YPL264CYPL264C 1062 nt7.57□□□□□ -1.2
SEC28P40509 RRT6YGL146C 936 nt7.56□□□□□ -1.2
SEC28P40509 APT1YML022W 564 nt7.55□□□□□ -1.2
SEC28P40509 TPO1YLL028W 1761 nt7.55□□□□□ -1.2
SEC28P40509 GRH1YDR517W 1119 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC28P40509 PET10YKR046C 852 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC28P40509 ELP4YPL101W 1371 nt7.54□□□□□ -1.2
SEC28P40509 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.53□□□□□ -1.2
SEC28P40509 LEO1YOR123C 1395 nt7.53□□□□□ -1.2
SEC28P40509 GDH1YOR375C 1365 nt7.53□□□□□ -1.2
SEC28P40509 SGF73YGL066W 1974 nt7.53□□□□□ -1.2
SEC28P40509 CPR2YHR057C 618 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC28P40509 TAD2YJL035C 753 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC28P40509 RCF2YNR018W 675 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC28P40509 PEX28YHR150W 1740 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC28P40509 PMT1YDL095W 2454 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC28P40509 CMK2YOL016C 1344 nt7.52□□□□□ -1.21
SEC28P40509 YPC1YBR183W 951 nt7.51□□□□□ -1.21
SEC28P40509 MRP1YDR347W 966 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC28P40509 ERG6YML008C 1152 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC28P40509 BAP3YDR046C 1815 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC28P40509 SPR1YOR190W 1338 nt7.5□□□□□ -1.21
SEC28P40509 PSP2YML017W 1782 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC28P40509 SMC5YOL034W 3282 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC28P40509 STE3YKL178C 1413 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC28P40509 YKR023WYKR023W 1593 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC28P40509 INP54YOL065C 1155 nt7.48□□□□□ -1.21
SEC28P40509 PNS1YOR161C 1620 nt7.47□□□□□ -1.21
SEC28P40509 CTF3YLR381W 2202 nt7.47□□□□□ -1.21
SEC28P40509 GGC1YDL198C 903 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC28P40509 CAR2YLR438W 1275 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC28P40509 ERV25YML012W 636 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC28P40509 CPT1YNL130C 1182 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC28P40509 PDC5YLR134W 1692 nt7.46□□□□□ -1.22
SEC28P40509 HEL1YKR017C 1656 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC28P40509 HXT9YJL219W 1704 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC28P40509 HAC1YFL031W 717 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC28P40509 RUP1YOR138C 2016 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YNL295WYNL295W 1575 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC28P40509 NUP53YMR153W 1428 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 RRP43YCR035C 1185 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 GET2YER083C 858 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 DAL80YKR034W 810 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 SNF7YLR025W 723 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 RTC2YBR147W 891 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YER152CYER152C 1332 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC28P40509 HRA1HRA1 564 nt7.43□□□□□ -1.22
SEC28P40509 SPE4YLR146C 903 nt7.43□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YPT10YBR264C 600 nt7.43□□□□□ -1.22
SEC28P40509 CRN1YLR429W 1956 nt7.42□□□□□ -1.22
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