Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 AVL9YLR114C 2295 nt8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 ADA2YDR448W 1305 nt8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 RPS6AYPL090C 711 nt8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 RPS6BYBR181C 711 nt8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 TIM50YPL063W 1431 nt8.34□□□□□ -1.07
SHQ1P40486 TAD2YJL035C 753 nt8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 CDA1YLR307W 906 nt8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 PRE10YOR362C 867 nt8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.33□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 JHD1YER051W 1479 nt8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 CKB1YGL019W 837 nt8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 YMR206WYMR206W 942 nt8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 YOR268CYOR268C 399 nt8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 YPL264CYPL264C 1062 nt8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 LPD1YFL018C 1500 nt8.32□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 PDC5YLR134W 1692 nt8.31□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 TES1YJR019C 1050 nt8.31□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 DST1YGL043W 930 nt8.3□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 RSC9YML127W 1746 nt8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 PEX28YHR150W 1740 nt8.29□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 RRT6YGL146C 936 nt8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 HAM1YJR069C 594 nt8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 AIM34YMR003W 597 nt8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 AOS1YPR180W 1044 nt8.28□□□□□ -1.08
SHQ1P40486 HXT9YJL219W 1704 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 UTR5YEL035C 501 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 EDC2YER035W 438 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 ARG7YMR062C 1326 nt8.27□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 ELP4YPL101W 1371 nt8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 SNA3YJL151C 402 nt8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 MNN9YPL050C 1188 nt8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 PRC1YMR297W 1599 nt8.26□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 TDH1YJL052W 999 nt8.25□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 YER152CYER152C 1332 nt8.25□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 ATP2YJR121W 1536 nt8.24□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 RUP1YOR138C 2016 nt8.23□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 RCF2YNR018W 675 nt8.22□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 LEO1YOR123C 1395 nt8.22□□□□□ -1.09
SHQ1P40486 ITR1YDR497C 1755 nt8.21□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 PMU1YKL128C 888 nt8.21□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 VPS65YLR322W 315 nt8.21□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 CHA1YCL064C 1083 nt8.2□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 ADE1YAR015W 921 nt8.2□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 SPE4YLR146C 903 nt8.2□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 ERV25YML012W 636 nt8.2□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 TOM71YHR117W 1920 nt8.2□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 BEM1YBR200W 1656 nt8.2□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 YLR030WYLR030W 792 nt8.19□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 YNL190WYNL190W 615 nt8.19□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 TOS1YBR162C 1368 nt8.19□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 YBL113CYBL113C 2379 nt8.18□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 YIL168WYIL168W 384 nt8.18□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 FUS3YBL016W 1062 nt8.18□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 MET30YIL046W 1923 nt8.18□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 NUP53YMR153W 1428 nt8.18□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 YJL043WYJL043W 774 nt8.17□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 MFG1YDL233W 1377 nt8.17□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 CPR2YHR057C 618 nt8.16□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 APT1YML022W 564 nt8.16□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 NSG2YNL156C 900 nt8.16□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 YHR033WYHR033W 1272 nt8.15□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 KAE1YKR038C 1161 nt8.15□□□□□ -1.1
SHQ1P40486 PET494YNR045W 1470 nt8.14□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 YDR476CYDR476C 675 nt8.14□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 LAS17YOR181W 1902 nt8.13□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 PET10YKR046C 852 nt8.12□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 YPC1YBR183W 951 nt8.12□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 YDR215CYDR215C 414 nt8.11□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 HNM1YGL077C 1692 nt8.11□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 STE3YKL178C 1413 nt8.11□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 GNA1YFL017C 480 nt8.1□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.1□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 YOR041CYOR041C 432 nt8.1□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 GNP1YDR508C 1992 nt8.1□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 DCR2YLR361C 1737 nt8.09□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 MAL31YBR298C 1845 nt8.09□□□□□ -1.11
SHQ1P40486 YNL295WYNL295W 1575 nt8.08□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 YLR173WYLR173W 1827 nt8.08□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 PSP2YML017W 1782 nt8.07□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 DAL80YKR034W 810 nt8.07□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 CAR2YLR438W 1275 nt8.07□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 PRE5YMR314W 705 nt8.07□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 TCB1YOR086C 3561 nt8.07□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 YKR018CYKR018C 2178 nt8.07□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 HOG1YLR113W 1308 nt8.06□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 BAP3YDR046C 1815 nt8.06□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 TPI1YDR050C 747 nt8.06□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 ATP10YLR393W 840 nt8.06□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 YDR306CYDR306C 1437 nt8.05□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 TOP3YLR234W 1971 nt8.05□□□□□ -1.12
SHQ1P40486 YMR253CYMR253C 1245 nt8.05□□□□□ -1.12
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