Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00862A6NCI5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00862A6NCI5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00862A6NCI5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00862A6NCI5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms