Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CGGBP1Q9UFW8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CGGBP1Q9UFW8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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