Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID3CA6NKF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID3CA6NKF2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms