Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPRTO14522 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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