Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMIPQ9P107 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GMIPQ9P107 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms