Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
WDR53Q7Z5U6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms