Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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