Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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EXT1Q16394 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EXT1Q16394 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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