Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFLP07196 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFLP07196 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms