Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms