Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP3Q6Q6R5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms