Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HIF1AQ16665 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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