Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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EXT1Q16394 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EXT1Q16394 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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