Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFLP07196 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFLP07196 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFLP07196 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFLP07196 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms