Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSO14618 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSO14618 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSO14618 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCSO14618 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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