Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3KRW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
J3KRW8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
J3KRW8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms