Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRTO14522 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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