Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HIF1AQ16665 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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