Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3KRW8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3KRW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3KRW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3KRW8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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