Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRT33BQ14525 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms