Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMT12Q53H54 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms