Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EXT1Q16394 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms