Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAD21O60216 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAD21O60216 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD21O60216 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD21O60216 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD21O60216 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD21O60216 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms