Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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