Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD21O60216 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD21O60216 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD21O60216 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD21O60216 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms