Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM36Q9NQ86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM36Q9NQ86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM36Q9NQ86 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM36Q9NQ86 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms