Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIGD2AQ9BW72 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms